通过高通量测序技术绘制基因表达图谱，可以揭示RNA在一个稳定状态下质和量上的变化，但是这仅仅是基因表达的一个“快照”，无法观察到RNA转录、加工和降解的细胞内动态过程。SLAM-seq，即thiol(sh)-linkedal

全长转录组测序（Iso-Seq）是基于PacBio Sequl II的单分子实时测序技术。该平台凭借超长读长的优势，无需打断RNA分子，直接对反转录的全长cDNA测序，即可得到从5’末端到3’PolyA尾的高质量全长转录本序列，从而准确鉴定异构体，可实现对可变剪切

GRO-seq (Global nuclear Run-On sequencing)是一种专门测量新生RNA的方法，可用于系统鉴定eRNA分子。