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创新组合测序方法揭示转录因子特殊调控机制

转录因子是哺乳动物细胞中一类重要的基因调控元件,很多疾病的发生都与转录因子功能失调有关。2015年,美国麻省总医院及哈佛医学院研究者联合在Science发文,公布了他们关于转录因子与基因调控元件中DNA及RNA之间

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新型CLIP技术让RBP-RNA互作研究化繁为简

紫外交联免疫共沉淀(CLIP)是一种用于研究RNA结合蛋白(RNA bindingprotein, RBP)-RNA互作关系的技术。 紫外交联免疫共沉淀(CLIP)是一种用于研究RNA结合蛋白(RNAbindingprotein,RBP)-RNA互作关系的技术。通过将此技术与高通量测序(CLIP-Seq)结合,可以在全转录组范围内鉴定出特定RBP-RNA互作

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新型ChIP-Seq技术实现超低细胞数量组蛋白修饰精确检测

 在2016年9月发布的Nature中,同济大学高绍荣教授研究组通过对组蛋白修饰技术ChIP-Seq加以改进,第一次系统检测了小鼠植入前胚胎发育各个时期全基因组范围内H3K4me3和H3K27me3两种重要组蛋白修饰分布与变化。

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CUT&Tag技术服务

CUT & Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),即靶向剪切及转座酶技术,是一种利用酶锚定技术进行高效、高分辨率的DNA测序文库构建方法。

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ATAC-seq整体服务

ATAC-seq (Assay of Transposase Accessible Chromatin with High-throughput sequencing),即染色质开放性检测,利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术。

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超级增强子鉴定服务

超级增强子 (Super Enhancer, SE) 为8 ~ 20 kb 具有转录增强活性的超长顺式作用元件,可富集高密度的关键转录因子(master transcription factors)、辅因子(cofactor)和增强子表观修饰标记(histone modification marks)

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CUT & RUN 技术服务

即核酸酶靶向切割和释放技术,是一项用于在细胞天然染色质环境下检测蛋白-DNA复合体的新方法。

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HiChIP高通量测序整体服务

HiChIP(insitu Hi-Cfollowedbychromatinimmunoprecipitation)是一种利用原位Hi-C原理和转座酶介导构建文库来解析染色质构象的方法。

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Hi-C

Hi-C(High-throughput chromosome conformation capture),即高通量染色体捕获技术,可在全基因组范围研 究 DNA 的相互作用,描绘高分辨率的染色质三维结构图谱,得到 A/B compartment、拓扑相关结构域(TAD)、染色质 环(loop)三个层级的信息。作为表观遗传学科研服务的国内先驱,表观生物可为客户提供 Hi-C 技术与表观多组学研究 手段联合分析的整体研究思路,从三维表观遗传组学层面深入研究疾病发生发展的机制。

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简化DNA甲基化测序RRBS

RRBS,即简化DNA甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing),是通过酶切富集启动子及CpG 岛区域并进行Bisulfite 测序的技术。

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