small RNA测序服务
small RNA-seq
miRNA是真核生物中广泛存在的一种长约21到23个nt的(RNA)分子,属于一种重要的非编码RNA,可调节其他基因的表达。成熟的miRNA非常稳定,不容易降解,进入血液后能长期滞留,发挥调控作用。miRNA通过靶向其靶基因mRNA,抑制mRNA,从而影响其靶基因表达,在细胞周期、肿瘤发生、干细胞分化等生物学过程中起重要作用。
piRNA
piRNA(Piwi-interacting RNA)是一类能够和 Piwi 蛋白结合并发挥功能的小非编码 RNA,其长度约为 24-33bp。在基因组内,piRNA 主要成簇分布,形成 piRNA cluster,在生殖细胞中,piRNA 的首位碱基往往具有很强的 U 偏好性。研究发现 piRNA 具有类似 miRNA 的调控机制,能够靶向 mRNA 的 3’UTR 并降解 mRNA,另外他们也能参与到转录水平的调控中,影响基因的表达。
tsRNA
tsRNA 是 tRNA 来源的小非编码 RNA,他们中的部分形成于 tRNA 的成熟过程,而其余部分则在 tRNA 形成成熟的二级结构之后,经特殊的酶进行酶切后而产生。研究表明,tsRNA 在表观遗传调控方面扮演着重要的角色。
表观生物利用最新的高通量测序技术和生物信息分析方案(样本≥10个,即送miRNA调控网络分析),为您提供最为全面的外泌体miRNA测序服务!
技术优势
1. 革新的QIAseq数字NGS建库技术,完美实现少量样本准确定量
2. 生物信息分析内容丰富,包含miRNA调控网络分析,无需额外费用!
送样要求
样本类型:
1. 细胞:≥ 2×10^5 个细胞/样本
2. 组织:≥ 0.5 mg/样本
3. RNA:≥ 推荐 1 μg/ 样本,RIN ≥ 6
样本物种:仅限人、大小鼠,其他物种需评估
分析内容
基础分析
1.原始数据过滤、质控
2.基因组、miRbase22、Rfam比对
3.miRNA分析
4.piRNA分析
5.tsRNA分析
6.small RNA差异表达分析
高级分析
1.small RNA靶基因分析
2.small RNA靶基因G0分析
3.small RNA靶基因KEGG分析
4.small RNA-mRNA调控网络图
图1. small RNA显著差异热图
分析示例
图2. 不同软件分析small RNA靶基因的交集维恩图
图3. 靶基因KEGG分析
图5. 靶基因GO分析气泡图
客户文章
1. Bai X, Chen X, Liu X, et al. Human milk exosomal miR-148a-3p targets Casp9 to activate HIF-1 mediated apoptosis and regulate gut-lung axis hypoxic injury: A new insight into innovative infant formula improvement. Chemical Engineering Journal, 2025: 169283.
2. Wang X, Xiang Z, Zhang Y, et al. CD25 downregulation by tumor exosomal microRNA-15a promotes interleukin-17-producing γδ-T-cells-mediated radioresistance in nasopharyngeal carcinoma. MedComm (2020). 2025;6(2):e70078. Published 2025 Feb 2.
3. Chen X, Wang X, Cui Z, et al. M1 Microglia-derived Exosomes Promote Activation of Resting Microglia and Amplifies Proangiogenic Effects through Irf1/miR-155-5p/Socs1 Axis in the Retina. Int J Biol Sci. 2023;19(6):1791-1812. Published 2023 Mar 21.
4. Xu W, Yu M, Wu Y, et al. Plasma-Derived Exosomal SncRNA as a Promising Diagnostic Biomarker for Early Detection of HBV-Related Acute-on-Chronic Liver Failure. Front Cell Infect Microbiol. 2022;12:923300. Published 2022 Jul 7.