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RNA与RNA相互作用 RIC-seq
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PAR-CLIP-seq:描绘RNA-蛋白质相互作用图谱
PAR-CLIP-seq(Photoactivatable Ribonucleoside-Enhanced Crosslinking and lmmunoprecipitation sequencing)即基于光活化核糖核苷的交联和免疫沉淀测序技术[1],将具有光活性的核糖核苷类似物4sU掺入到新转录的RNA中,再通过分析碱基T-C转换位点,可在全转录组范围内研究RNA与蛋白的相互作用,揭示靶向RBP的RNA结合位点。
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RADICL-seq
RADICL-seq(RNA And DNA Interacting Complexes Ligated and sequenced)是一种探索 RNA 与染色质相互作用 的新技术,绘制细胞核内 RNA 与染色质的相互作用图谱,能够鉴定不同类转录本的基因组覆盖模式,以及细胞特异性的 RNA- 染色质相互作用。利用 RADICL-seq 可以在 RNA 与基因组靶标区域相互作用时捕获 RNA,并对捕获的每个 RNA 进行 全面定位。
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OmniRNA-seq:真正全转录组,一个文库检出八种RNA表达图谱!
表观生物全新推出微量全转录组测序服务OmniRNA-seq,解决传统建库方法对RNA末端修饰的依赖问题,实现更全面的转录组覆盖,绘制多维RNA图谱。OmniRNA-seq具有高灵敏度,其核心优势在于检测更多RNA种类和片段,一次测序即可对mRNA、lncRNA、sncRNA(如miRNA、tsRNA等)多种RNA分子进行全面分析。为疾病标志物开发、癌症早筛等研究提供强大技术支持。
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PANDORA-seq
非编码小RNA(small non-coding RNAs, sncRNAs), 主要长度为15~45bp, 具有细胞调节功能的一类RNA。
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SLAM-seq动态转录组(RNA代谢)
SLAM-seq能检测整合到总RNA中的核苷类似物4-硫尿苷(s4U),绘制RNA聚合酶II依赖性的基因表达动态,是一种操作性强、稳定、可靠的基因表达调控机制研究方法。
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GRO-seq:新生RNA测序服务
GRO-seq (Global nuclear Run-On sequencing)是一种专门测量新生RNA的方法,可用于系统鉴定eRNA分子。
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RIP-seq
RIP(RNA Immunprecipitation)是研究细胞内 RNA 与蛋白结合情况的技术,适用于研究转录后调控网络动态过程, 能帮助我们发现特定蛋白质的目标 RNA 分子,包括 lncRNA、mRNA 或其他非编码 RNA。RIP 实验运用针对目标蛋白的抗体, 沉淀相应的 RNA- 蛋白复合物,经过分离纯化,后续可对结合在复合物上的 RNA 进行 qPCR(RIP-qPCR)、芯片分析(RIP-chip) 或测序(RIP-seq)。
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DRUG-seq:基因干扰下的数字RNA测序技术
Epi™ DRUG-seq(Digital mRNA with pertUrbation of Genes)快速转录组测序技术针对微量细胞和组织样本,采用携带Barcode标签和UMI序列的oligo dT磁珠,高效结合mRNA上Poly(A)尾端,进行反转录和文库构建。DRUG-seq 极大降低了样本要求和测序成本,可广泛应用于生命科学基础研究、转化医学及新药开发等相关领域。
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LongRNA-seq(circRNA+lncRNA+mRNA)
LongRNA-seq是一种全面检测细胞和组织长片段RNA(>200nt)的转录组测序方法,包括线性的mRNA和lncRNA分子,以及环状RNA,可准确高效揭示转录组的表达全貌,是非编码RNA的重要研究技术.
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