Gibson无缝连接试剂盒:Epi™ 2×HiFi Gibson Assemble Mix Kit

产品简介
Gibson组装是一种等温无缝克隆方法,能够高效的组装多个DNA片段,将一个或多个插入片段定向、快速、准确地插入到线性化载体中,最终构建的重组克隆无任何额外的碱基序列残留。
表观生物Epi™ 2×HiFi Gibson Assemble Mix kit,可实现高保真、高稳定性、高效、简便的DNA连接效果,适用于大量文库构建、蛋白表达等场景。
产品信息

技术原理
Gibso 组装没有酶切位点的限制,线性化载体可通过限制性内切酶酶切或通过 PCR 的方法直接制备,在插入片段的两个 PCR 引物的 5' 端引入与载体克隆位点两端完全相同 15~25bp 的重叠序列充当同源臂。带有同源臂的插入片段和线性化载体按一定比例混合后,在重组酶的催化下,50℃反应 10 - 20min 即可转化。

图1. Gibson组装原理示意图
A)Giboson组装中的三种酶具体工作原理;B)单个插入片段组装;C)多个插入片段组装。彩色区块为同源臂,退火温度要高于 48℃。Gibson组装的反应体系包含T5核酸外切酶,高保真DNA聚合酶,和Taq DNA连接酶。T5核酸外切酶具有很强的5' → 3'的核酸外切酶活性,酶切克隆片段产生3'端突出的粘性末端,同源末端之间会进行碱基互补配对,随后高保真DNA聚合酶按照5' → 3'方向填补间隙。Taq DNA连接酶在缺刻处将5'磷酸和3'羟基连成磷酸二酯键
产品亮点
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高保真性:克隆准确率>95%,所见即所得
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高稳定性:液态的Mix,避免反复冻融,避免酶活损失
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高效:克隆数目多,可用于大容量文库的构建
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简便:Mix和样品等体积混匀即可
产品应用
1. DNA连接
2. 分子克隆
3. 蛋白表达
4. 定点突变
5. 小基因组组装
实测数据

图2. 本试剂盒实测效果
A)反应产物转化感受态细菌DH5α后涂布LB平板效果图。单个800 bp的插入片段,800 bp和500 bp等多片段插入;B)菌落PCR鉴定重组克隆,全部为阳性
注意事项
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载体和插入片段的摩尔之比介于1:2之间;
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同源臂的长度推荐为15~40 bp,引物融解温度要高于50℃;
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载体要线性化,PCR获得载体时,最好用DpnI消化模板,防止干扰下游实验;
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单个插入片段的PCR产物进行重组反应时,若条带单一,无须纯化可直接进行重组反应,但PCR产物的体积不得超过重组反应体系的20%,重组效率通常会低于纯化后的PCR产物;
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多片段重组反应,最好切胶回收载体和插入片段。
应用案例
Nat Microbiol:KorB蛋白如何从DNA滑动夹转变为长程基因沉默的抑制因子(DOI: 10.1038/s41564-024-01915-3)
这篇文章揭示了多重耐药质粒RK2中KorB蛋白的新机制:KorB作为CTP依赖的DNA滑动钳,能在DNA上滑行到达远距离目标启动子。KorA蛋白通过锁定KorB的闭合钳状态,将其从滑动钳转换为转录抑制子,实现长距离基因沉默。这种机制为细菌长距离转录调控提供了新的分子基础,有助于理解多重耐药质粒的调控网络。

图1. 该研究使用Gibson组装在质粒构建过程中进行DNA片段连接;构建了多种质粒用于后续的蛋白表达和功能研究