简化DNA甲基化测序RRBS

项目简介
RRBS
RRBS,即简化DNA甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing),是通过酶切富集启动子及CpG 岛区域并进行Bisulfite 测序的技术。与WGBS相比,RRBS性价比更高,测序量更少,适合大规模临床样本研究。
应用与优势
技术应用
1.绘制全基因组甲基化图谱
2.研究胚胎发育、衰老等生理活动发展的表观遗传机制
3.研究疾病相关甲基化分子标志物
技术优势
1.性价比高
2.测序量减少,适合大规模临床样本
送样要求
样本类型:
≥ 1ug/样本,浓度≥ 25ng/ul
DNA
≥5x106个细胞/样本
细胞
1~4ml/样本
全血
≥30mg/样本
动物组织
样本物种:仅限人、大小鼠,其他物种需评估
分析内容
1. 基因组比对统计
2. MSPI酶切及Bisulfite转化率质控
3. 甲基化位点分析
4. 甲基化分布图
5. 差异甲基化区域注释
6. 差异甲基化区域相关基因GO、KEGG富集分析

差异甲基化区域IGV图
分析结果示例

差异甲基化区域KEGG富集分析

差异甲基化区域平均甲基化水平分布

染色体水平甲基化分布

样本间甲基化分布PCA分析结果