糖RNA高分新成果(IF 40.1): 肝脏代谢性疾病中糖基化RNA生物发生受损及其在MASH中的功能研究

2026-07-03

背景

 

代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)及其进展形式MASH是全球常见慢性肝病之一,其核心病理机制涉及脂质代谢紊乱、慢性炎症及肝细胞损伤。然而,目前对早期“代谢-炎症耦合”机制的分子基础仍缺乏充分解释。

近年来,细胞表面RNA(glycoRNA)作为一种新发现的RNA修饰形式,被证实参与免疫调控与细胞间相互作用。但其在肝脏代谢疾病中的表达状态及功能尚未明确。肝脏疾病进程中glycoRNA是否发生改变,并是否参与MASH发生发展过程?


图片

最近发表于Journal of Hepatology》(IF: 40.1),题为“Impaired glycoRNA biogenesis in metabolic-dysfunction associated steatotic liver disease”。该研究由德国汉诺威医学院(Hannover Medical School)Amar Deep Sharma团队牵头完成,第一作者为中国学者Chengji Dong。研究揭示了MASLD/MASH进程中,肝细胞表面glycoRNA及其生物发生酶SIDT1/DTWD2显著下调。glycoRNA缺失会驱动脂质沉积与炎症,而恢复其表达能缓解肝损伤。此外,Resmetirom的疗效部分依赖该通路,为MASH治疗提供了新靶点。

关键研究结果


1、肝细胞脂质负荷诱导glycoRNA显著下调

研究首先在PHH及肝癌细胞系中证实,脂质过载(FFA处理)可显著降低glycoRNA表达水平,该变化在不同检测体系(ARPLArPAL)中均一致。同时,U1Y5等代表性glycoRNA信号同步下降,提示脂质应激直接影响glycoRNA稳态,可能构成脂肪变性早期分子事件之一。

图片1.A)展示ARPLA检测glycoRNA的实验流程及多重对照体系(无探针、无连接子、随机序列对照),用于验证检测体系特异性;CrPAL方法在PHHHepG2Huh7细胞中检测glycoRNA的荧光信号强度,显示PHH中信号最强,肿瘤细胞系略有差异;D-E)定量分析显示不同细胞类型中glycoRNA水平存在显著差异,并在FFA处理后整体下降;FU1Y5 glycoRNA在正常与FFA处理条件下的原位检测图像;GU1/Y5 glycoRNA荧光强度定量,显示脂质负荷显著抑制glycoRNA表达。

2、Resmetirom可恢复脂质应激下的glycoRNA表达

在脂质诱导的glycoRNA下降模型中,Resmetirom处理可显著恢复glycoRNA表达水平,并在PHH及肝癌细胞中均表现一致效果。同时,其作用伴随关键糖基化相关蛋白表达恢复,提示该药物可能通过调控glycoRNA生物发生通路改善脂代谢紊乱。

图片

2.A实验设计示意图,展示PHHFFA诱导脂肪变后进行Resmetirom干预及glycoRNA检测流程;BrPAL检测总glycoRNA信号,显示FFA处理降低信号,而Resmetirom显著恢复;C)对B图信号进行定量分析,显示Resmetirom组显著上升;D-EU1Y5 glycoRNA在不同处理组中的荧光成像;F-G)肝癌细胞系中同样观察到ResmetiromglycoRNA表达的恢复作用。

3、抑制glycoRNA合成加重脂肪变并削弱药物作用

通过多种N-糖基化抑制剂及RNA降解处理,研究发现阻断glycoRNA合成显著加重脂质沉积并增强肝细胞损伤表型,同时明显降低Resmetirom的治疗效果,提示glycoRNA通路在脂代谢稳态及药物响应中具有关键调控作用。

图片

3.C)不同糖基化抑制剂(NGI-1Swainsonine等)处理后glycoRNA检测结果,显示信号显著下降;DARPLA验证glycoRNA检测特异性,RNA或糖基化被破坏后信号消失;E)甘油三酯(TG)水平测定,显示抑制glycoRNA合成显著增加脂质积累;F-J)不同处理条件下脂质代谢相关指标变化,整体显示glycoRNA缺失加重脂肪变并降低药物响应。

4、SIDT1与DTWD2表达下调导致glycoRNA生物发生障碍

研究进一步发现,SIDT1RNA转运蛋白)与DTWD2(修饰酶)在MASH模型中显著下调,导致glycoRNA生成受阻。在细胞及动物模型中恢复这两种蛋白表达,可有效提升glycoRNA水平并改善脂肪变及炎症表型。

图片

4.ASIDT1定位于细胞膜并参与RNA转运的示意图;BDTWD2催化RNA修饰(acp³U)过程示意;CWestern blot显示FFA处理降低SIDT1DTWD2表达;D)蛋白表达定量分析验证下降趋势;G-JCDEGAN模型中SIDT1/DTWD2表达显著降低的体内验证。

5、上调SIDT1/DTWD2可改善MASH表型

在两种MASH小鼠模型中,AAV介导的SIDT1DTWD2过表达显著恢复glycoRNA水平,并改善脂肪沉积、炎症及肝功能指标。结果表明增强glycoRNA生物发生可有效缓解MASH进展,提示其潜在治疗价值。

图片

5.E-FglycoRNA检测及肝组织病理(H&EOil Red O)显示脂质沉积减少;G-I)体重、肝重及肝指数变化,提示代谢改善;D-H(右)GAN模型中重复验证改善效果,包括炎症与脂质指标下降。

6、glycoRNA通过调控炎症反应影响肝-免疫轴

在肝细胞-巨噬细胞共培养体系中发现,SIDT1/DTWD2下调导致促炎因子上升,而其过表达则增强抗炎信号,说明glycoRNA不仅调控代谢,还通过细胞表面RNA信号参与免疫调控,可能影响MASH向炎症阶段转化。
图片
7.C-DsiRNA与过表达验证SIDT1/DTWD2调控效率;E-FrPAL检测glycoRNA变化,显示敲低降低、过表达升高;G)炎症因子(IL-6IL-1β等)与抗炎因子表达变化;H-ISIDT1DTWD2分别调控炎症因子表达趋势。

7、人类MASH患者中glycoRNA及关键酶表达异常

在人类样本中,MASH患者肝组织中SIDT1DTWD2glycoRNA均显著降低,并伴随RNA组成谱改变,提示glycoRNA异常具有潜在临床相关性,可能作为疾病诊断及分型标志物。

图片

8.A)患者与健康对照中SIDT1/DTWD2 mRNA表达对比;B)免疫组化显示两种蛋白在MASH中表达降低;CrPAL检测患者肝组织glycoRNA显著下降;E-FRNA组成及差异分析,显示MASHRNA谱发生系统性重塑。

小结

图片

该研究系统揭示glycoRNAMASLD/MASH中的动态变化及其功能意义,指出其不仅参与肝细胞脂质代谢稳态维持,还通过调控SIDT1/DTWD2相关生物发生通路影响炎症反应。研究进一步提出glycoRNA可能作为疾病早期标志物,并参与药物Resmetirom的部分作用机制。然而,目前glycoRNA检测与单分子解析技术仍有限,其在不同肝细胞类型及免疫细胞中的精细功能尚未完全明确。未来需进一步解析其细胞来源异质性及分子作用机制,以推动其在肝病诊断与治疗中的转化应用。

图片
图片
图片

 

 

图片
图片

 


服务导航

图片

 

表观基因组

图片
WGBS
msRRBS
Hi-C
HiChIP
ChIP-seq
CUT&Tag
ATAC-seq/MS
ACC-seq/MS
CUT&RUN
ecDNA-seq
超级增强子鉴定
表观时钟
WES
WGS
Pore-C

表观转录组

图片
meRIP-seq
acRIP-seq
m6Am-Exo-seq
m1A-seq
TRAC-seq(m7G)
PA-Ψ-seq
m5C-BS-seq
GlycoRNA-seq
ONT Direct RNA 全长转录组测序
SELECT m6A修饰
定量检测试剂盒
RNA糖基化研究整体服务
 

转录与调控

图片
PANDORA-seq
RADICL-seq
RIC-seq
long RNA-seq
small RNA-seq
CRIC-seq
SLAM-seq
GRO-seq
RIP-seq
ISO-SLAM-seq
PAR-CLIP-seq
rPRO-seq
rG4-seq
   

 

翻译组

图片
Ribo-seq
Active Ribo-seq
Polysome-seq

 

单细胞组

图片
10x 单细胞转录组
BD单细胞ATAC-seq
BD单细胞CUT&Tag
BD单细胞转录组
CROP-seq/Perturb-seq
单细胞Hi-C
华大单细胞转录组
单细胞免疫应答靶向捕获测序
BD单细胞TCR/BCR-seq
   

 

空间组

图片
空间转录组

免疫组库

图片
TCR-seq/BCR-seq

核酸液体活检与药物筛选

图片
OmniRNA-seq
外泌体
long RNA-seq
small RNA-seq
DRUG-seq
cfChIP-seq
cfWGBS
cfDNA片段组学
FragMethyl-seq
   

蛋白质组

图片
定量蛋白质组
表观修饰质谱
Co-IP/MS
TurboID
   

蛋白相分离

图片
蛋白相分离研究系列服务
TurboID

更多服务

图片
肿瘤类器官构建及多组学测序服务

CRISPR/Cas9 VLP 基因编辑类病毒颗粒

Epi™ Gapmer ASO设计及合成服务
个性化肿瘤mRNA疫苗整体开发方案
新型表观遗传编辑器
Epi™ PEmax先导编辑工具
SEC-HPLC 外泌体纯度检测服务
纯度>90%,17倍回收率!植物囊泡提取服务正式上线

表观云分析平台

 

 

图片
图片

www.epicloud.cc

识别二维码进入表观云

关于我们

 

 

图片

 

广州表观生物科技有限公司(简称:表观生物® Guangzhou Epibiotek Co., Ltd.)是由多位资深生物技术专家共同创办的高新技术企业,广东省专精特新中小企业,具备ISO9001质量管理体系认证。旗下设有专注于合成生物学领域的M³M立方生物制造中心。

表观生物专注于医学表观遗传学、转录调控研究与及合成生物学三大领域。针对超级增强子、染色质3D结构、表观转录组、空间互作组、RNA结合蛋白、单细胞表观组、蛋白相分离等热门研究领域提供全面的表观测序技术及整体解决方案,致力于成为全球领先的表观遗传学研究服务提供商。通过自主研发,并搭建表观云®分析平台EpiCloud®”。表观云平台将建立“肿瘤外泌体RNA标志物数据库”及“医学表观组学数据库”,提供专业的疾病健康数据库及大数据分析框架。

图片

2017年至今合作高校、科研院所及三甲医院超600+,企业100+。已助力客户在NatureCellCancer CellMolecular Cancer等国际顶级期刊发表多篇文章。

图片
更多产品服务研究资讯请关注公众号表观生物”或官网。
🌐表观生物官网🌐

 

- - - 推荐阅读 - - -