DRUG-seq建库试剂盒，药物筛选利器
DRUG-seq建库试剂盒
Epi™ DRUG-seq Library Prep Kit是一款用于快速转录组测序的建库试剂盒，针对微量细胞或组织样本，低细胞起始量（1,000~10,000）即可实验；无损直检，裂解液直接上样，避免RNA提取损耗；无需自备磁珠，通过独特的分子标签，高效且灵敏捕获mRNA，可实现多样本混合建库，每个UMI可对捕获的mRNA进行精确定量，以降低PCR扩增带来的数据遍差。凭借低样本量低成本高效批量化检测的优势，广泛应用于药物筛选、肿瘤溯源、类器官等研究领域。
试剂盒信息
实验流程
产品亮点
1. 低样本起始量，1,000~10,000个细胞均可实验，适用多细胞类型或类器官等
2. 独特的barcode+UMI可实现多样本合并建库和精准定量，可批量化测序，成本远低于常规RNA-seq
3. 细胞样本无需提取RNA，直接裂解后建库，简化流程并减少批次差异
技术应用
1. 药物筛选与开发（靶点识别、化合物评估等）
2. 肿瘤等疾病机制研究（肿瘤溯源、生物标志物发现等）
3. 干细胞与类器官研究
4. 基因功能研究
测序送样要求
1. 混合样品数：5~8个
2. 文库片段：600~800 bp
3. 浓度和体积：浓度≥10 ng/μL，体积＞20 μL
4. 推荐测序数据：10 M/子文库(如5个样品混合则50 M/文库)
分析内容
1. 数据质控
2. 基因比对与统计
3. 差异表达分析
4. 基因功能GO分析
5. 代谢通路KEGG分析
6. 差异基因热图分析
数据分析示例
研究案例
1.Cell Stem Cell：利用iPSC衍生的静脉内皮细胞建模血管畸形及药物发现（DOI: 10.1016/j.stem.2024.10.015）
这篇文章利用iPSC分化、CRISPR-Cas9、体外功能测定、体内肾包膜移植和DRUG-seq等方法，生成了携带TIE2基因突变的人类静脉内皮细胞（iVEC），构建了能模拟人类静脉畸形（VM）的体外和体内模型，并通过AI辅助的DRUG-seq筛选发现Bosutinib是潜在的治疗药物。研究中利用DRUG-seq结合深度学习模型（DLEPS），对携带TIE2突变的iVEC进行了高通量药物筛选，通过分析候选药物处理后细胞的转录组变化，识别能够逆转VM表型、使突变细胞转录组更接近野生型细胞的潜力药物。
2.Oncogene：结核分枝杆菌通过EsxB抑制METTL14介导的Nox2 mRNA m6A甲基化以削弱抗结核免疫（DOI: 10.1038/s41388-025-03309-z）
这项研究通过整合单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq，结合CRISPRi、ATAC-seq及DRUG-seq等技术，探究了全反式维甲酸（ATRA）诱导PML/RARα+急性早幼粒细胞白血病（APL）细胞系NB4分化的调控机制。研究发现ATRA通过激活PML/RARα靶向增强子，触发SPI1和CEBPE转录因子形成的正向调控环路，驱动NB4细胞跨越命运决策点完成终末粒细胞分化，并在非APL白血病细胞（HL60、K562）中验证了该环路的普适性分化诱导作用。其中DRUG-seq用于高通量分析SPI1和/或CEBPE过表达在NB4、HL60和K562细胞中的转录组效应，揭示了这些转录因子单独或协同激活粒细胞相关基因（如中性粒细胞脱颗粒通路），证实其在缺乏ATRA时仍能诱导部分分化程序。
3.Oncogene：基于体内、类器官和患者数据的揭示CRIPTO在驱动侵袭性前列腺癌中的多层面作用（DOI: 10.1038/s41388-024-03230-x）
这项研究通过结合小鼠模型、类器官培养和患者数据，深入探讨了CRIPTO在前列腺癌发生和进展中的作用。研究人员构建了在前列腺特异性表达可诱导型Cre酶，并在CARNs（castration-resistant Nkx3.1-expressing cells，前列腺癌中发生癌变的靶细胞群）中敲除Cripto的转基因小鼠模型 。通过对不同基因型小鼠进行去势和睾酮再给药处理，模拟前列腺癌的进展过程。研究还分析了欧洲多中心高危前列腺癌临床和转化研究组（EMPACT）患者队列的组织芯片（TMA）数据，评估CRIPTO表达与临床及PSA进展的相关性。其中利用BRB-seq（DRUG-seq）对小鼠前列腺组织和类器官的转录组进行了测序和分析，重点分析了差异表达基因的功能富集，特别是MYC靶基因的变化。研究结果发现CRIPTO 驱动侵袭性前列腺癌的发生和进展，且与MYC协同作用，提示CRIPTO是潜在的治疗靶点和生物标志物。