单细胞ATAC：单细胞分辨率的染色质可及性，更高精度地探索细胞内部的调控机制

1. 将细胞或组织制备细胞核悬液，加入Tn5转座酶进行批量切割插入 2. 细胞核标记与分选，生成液滴（DNBelab C4配备4个独立控制的微流控通路，支持1-4样本的灵活上样。scATAC文库制备过程中的细胞核分离、标记过程仅需6分钟） 3. 回收液滴进行PCR，破乳回收DNA，构建单细胞ATAC文库 4. 文库pooling后进行高通量测序（DNBSEQ-T7日产可高达7 Tb，4联载片平台，支持PE150和PE100不同读长并行测序）

这项研究探讨了干扰素调节因子8（IRF8）在出生后小胶质细胞发育和阿尔茨海默病发病机制中的作用。为了解IRF8如何调控小胶质细胞的出生后成熟，作者使用了多种测序技术，包括CUT&RUN、RNA-seq、ATAC-seq、WGBS、scRNA-seq与scATAC-seq联合分析。通过分析IRF8结合位点、转录组、染色质可及性、DNA甲基化和单细胞基因表达，研究发现IRF8在出生后逐步结合到小胶质细胞的增强子区域，协调表观遗传变化，从而指导小胶质细胞特异性基因的表达。其中，作者为了探究IRF8对小胶质细胞染色质可及性的影响及其与转录组的关联，研究人员使用scATAC-seq分析了野生型和IRF8cKO小胶质细胞的染色质可及性图谱、转录因子结合基序、以及染色质可及性与基因表达的关系。此外，还分析了5xFAD模型中吞噬Aβ斑块的小胶质细胞的染色质状态，并与IRF8缺失的影响进行了比较。这项研究表明，IRF8对于建立出生后小胶质细胞的表观遗传图谱和转录程序至关重要，并暗示IRF8可能是AD治疗的潜在靶点。