技术原理
Pacbio 全长转录组 Iso-seq 服务

全长转录组测序(Iso-Seq)是基于PacBio Sequl II的单分子实时测序技术。该平台凭借超长读长的优势,无需打断RNA分子,直接对反转录的全长cDNA测序,即可得到从5'末端到3'PolyA尾的高质量全长转录本序列,从而准确鉴定异构体,可实现对可变剪切(Alternative Splicing, AS)、可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)、

可变转录起始位点(Alternative Transcription Start Sites ,ATSS)等多项二代测序所无法实现的分析能力,打开了一扇通往RNA世界的新大门!

技术优势: 1. 三代测序无需组装可获得准确度大于99%的高质量转录本(HQ high-quality isoforms) 2. 使用最新Iso-Seq3分析流程,获取最新分析手段 3. 使用最新的全长转录本的功能分析(FIT Functional Iso-Transcriptomics analysis) 4. 数据分析多种选择,定制分析内容

分析内容

Iso-Seq基本分析
1、 获得高质量全长转录本 2、 全长转录本与基因组比 3、 全长转录本去冗余 4、 转录本结构注释 5、 新转录本预测 6、 融合基因鉴定 7、 剪切位点分析
Iso-Seq高级定制分析
1、AltTP分析 2、功能多样性分析(FDA) 3、差异和异构体差异表达性分析(DE/DIU) 4、富集分析 5、特征差异表达性分析(DFI) 6、polyA差异表达分析(DPA) 7、转录水平功能机制分析